Научная деятельность в заповеднике складывается из трех крупных блоков:
1) Индивидуальная научная работа сотрудников. За каждым научным сотрудником закреплена индивидуальная тема, соответствующая специализации сотрудника и утвержденная научно-техническим советом.
2) Экологический мониторинг по программе ведения Летописи природы.
3) Совместные изыскания со сторонними исследователями. На данный момент у нашего заповедника заключено несколько договоров о научном сотрудничестве.